功能基因与分子标记

红鳍东方鲀BAC数据库和ESTs数据库中微卫星的筛选与应用 郝君,孙效文,孟雪松,冯摇剑

摘要: 利用Tandem Repeats Finder 软件在红鳍东方鲀Takifugu rubriper BAC 数据库和ESTs 数据库中查找微卫星标记。选取其中22 个序列(11 个BAC-SSRs 序列、11 个EST-SSRs 序列) 设计引物, 并将22 对引物用于庄河、河北玉和河北域3 个群体, 均能扩增出产物, 其中EST-SSRs 有2 对引物扩增产物比预期扩增产物偏大, 可能是相应基因组中有内含子导致。研究结果表明, EST-SSRs 标记要比BAC-SSRs 标记的多态性低, 其中11 个BAC-SSRs 和9 个EST-SSRs 标记有很好的多态性, 可以用于红鳍东方鲀的遗传多样性分析和重要经济性状筛选等方面的
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